尽管沉管隧道具有众多的优越性，我国在沉管隧道修建技术方面也取得到了一系列成果，但由于目前我国采用沉管法修建的隧道比较少，在许多方面仍不成熟，仍存在许多问题有待解决。 ⑴沉管接头 沉管接头是沉管隧道区别于其它隧道的更大特点，目前已建沉管隧道的接头方式过于复杂， 受力机制不明确，而且不利于防水，沉管接头的形式及其防水结构设计等都有待研究。 ⑵水下边坡 主要包括水下基槽成槽技术与精度控制、水下基槽边坡的合理经济性设计等方面，施工过程应严格控制基槽开挖过程导致的泥砂流失。 ⑶基础处理 沉管基础的处理方式较多，但是对其最终密实性与整体质量的控制都差强人意，致使工后差异沉降严重，对工后管段结构安全不利； ⑷回淤与环境评价 对于水环境的影响研究得不够，导致回淤严重、工控不良。严重的甚至严重影响施工过程中水下基槽边坡失稳与管段沉放与对接，影响施工质量与工期，工后泥沙淤积现象严重，进而造成严重环境问题； ⑸防水问题 关于防水问题主要包括如下几个方面：管段自身防水、底钢板与外防水板的采用与类型、管段接头防水等； ⑹耐久性与长期可靠性 隧道整体及管段的抗渗透与耐久性及长期可靠性缺少合理评价措施与手段； ⑺管段长度及浇注段的合理划分问题； ⑻温控与防裂问题； ⑼超长管段与超大断面情况下的设计与施工技术问题； ⑽管段浮运、沉放与对接控制技术问题； ⑾相关配套工程也未形成体系； ⑿修建技术尚未规范化； ⒀基槽开挖、管段浮运、沉放对水域生态及航运的影响问题； ⒁岸上段及护岸工程对水利防洪影响问题； ⒂造价偏高； ⒃目前我国尚未形成沉管隧道的设计、施工与验收规范。